feat: add /research/report command for markdown generation

- New report command to generate markdown from JSON results
- Generates Python script for conversion
- Creates report with TOC and anchor links
- Skips uncertain fields and uncertain array
- Update deep.md with prompt template format

🤖 Generated with [Claude Code](https://claude.com/claude-code)

Co-Authored-By: Claude Opus 4.5 <noreply@anthropic.com>

README.md

@@ -19,6 +19,7 @@ A structured research workflow skill for Claude Code, supporting two-phase resea
 | `/research/add-items` | Add more items to existing outline |
 | `/research/add-fields` | Add more fields to existing outline |
 | `/research/deep` | Deep research each item with parallel agents |
+| `/research/report` | Generate markdown report from JSON results |
 
 ## Installation
 
@@ -87,6 +88,14 @@ basic_info:
 ### Research Result (JSON)
 Each item outputs a structured JSON file with all defined fields.
 
+### Phase 3: Generate Report
+```
+/research/report
+```
+- Generates Python script to convert JSON to markdown
+- Creates report with table of contents and anchor links
+- Skips uncertain fields automatically
+
 ## References
 
 - RhinoInsight: Improving Deep Research through Control Mechanisms for Model Behavior and Context

skills/research/deep/SKILL.md

@@ -18,14 +18,25 @@ allowed-tools: Bash, Read, Write, Glob, WebSearch, Task
 - 跳过已完成的items
 
 ### Step 3: 分批执行
-- 按batch_size分批（默认5个agent并行）
+- 按batch_size分批（完成一批需要得到用户同意才可进行下一批）
 - 每个agent负责items_per_agent个项目
-- 启动web-search-agent（后台并行，禁用task output）
+- 启动web-search-agent（后台并行，禁用task output），使用以下prompt模板：
-- **硬约束**：仅传入item相关信息和输出路径
+
-- **硬约束**：agent必须自行读取 `{topic}/fields.yaml` 获取字段定义
+```
-- **硬约束**：禁止在prompt中直接嵌入字段定义
+## 任务
-- **硬约束**：不确定的字段值标注[不确定]，并在JSON末尾uncertain数组中列出该字段名(即对应字段的实际位置需要说明一次和uncertain字段位置再总结一次)
+调研 {item_related_info}，输出结构化JSON到 {output_path}
-- 输出结构化JSON到output_dir
+
+## 字段定义
+读取 {topic}/fields.yaml 获取所有字段定义
+
+## 输出要求
+1. 按fields.yaml定义的字段输出JSON
+2. 不确定的字段值标注[不确定]
+3. JSON末尾添加uncertain数组，列出所有不确定的字段名
+
+## 输出路径
+{output_dir}/{item_name}.json
+```
 
 ### Step 4: 等待与监控
 - 等待当前批次完成
@@ -39,7 +50,6 @@ allowed-tools: Bash, Read, Write, Glob, WebSearch, Task
 - 输出目录
 
 ## Agent配置
-- 每批并行: 5个agent（可在outline中配置）
 - 后台执行: 是
 - Task Output: 禁用（agent完成时有明确输出文件）
 - 断点续传: 是

skills/research/report/SKILL.md

@@ -0,0 +1,31 @@
+---
+description: 将deep调研结果汇总为markdown报告，覆盖所有字段，跳过不确定值。
+allowed-tools: Read, Write, Glob, Bash
+---
+
+# Research Report - 汇总报告
+
+## 触发方式
+`/research-report`
+
+## 执行流程
+
+### Step 1: 定位结果目录
+在当前工作目录查找 `*/outline.yaml`，读取topic和output_dir配置。
+
+### Step 2: 生成Python转换脚本
+在 `{topic}/` 目录下生成 `generate_report.py`，脚本要求：
+- 读取output_dir下所有JSON
+- 读取fields.yaml获取字段结构
+- 覆盖每个JSON的所有字段值
+- 跳过值包含[不确定]的字段
+- 跳过uncertain字段
+- 生成markdown报告格式：目录（带锚点跳转）+ 详细内容（按字段分类）
+- 保存到 `{topic}/report.md`
+
+### Step 3: 执行脚本
+运行 `python {topic}/generate_report.py`
+
+## 输出
+- `{topic}/generate_report.py` - 转换脚本
+- `{topic}/report.md` - 汇总报告